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GPU高性能计算集群

功能

计算能力的增强使得蛋白质质谱检索所需的时间和分析蛋白组数据所需的时间大幅减少,而基于GPU并行计算架构的基因序列分析算法相对于传统的CPU串行算法,能够获得几倍、十几倍的加速,极大地提高了科学研究工作的效率和时效性。此外,作为院内公共计算平台,该集群还为其他科研工作如中子学计算、颗粒流模拟、材料计算提供了支持,为近物所自主研发的高性能计算软件提供了运行、测试平台。

应用

该设备是基于NVIDIA KEPLER架构的GPU-CPU异构高性能计算集群。集群总共配置16个计算节点,1个管理节点,3个服务器机柜,1个64TB的磁盘存储阵列以及1个40Gb带宽的IB交换机。计算节点配置2个INTEL XEON E5-2630V2至强系列服务器CPU,64GB DDR3内存,2TB硬盘,4块NVIDIA TESLA K20高性能计算卡,1块40Gb IB网卡以及1600瓦电源。集群总共拥有68块高性能计算卡,单精度浮点计算理论峰值为239.36TFlops(239.36万亿次/秒)。

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